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密码子适应指数（CAI）分析

密码子适应指数（CAI）是指编码区同义密码子与最佳密码子使用频率的相符程度，取值在0~1之间。CAI可以用来评估外源基因在宿主内的表达水平，CAI越高，则外源基因在宿主内的表达水平越高。

密码子适应指数分析工具的工作原理为：以高表达基因的序列为参考（参考序列），评估目的基因与参考序列的密码子使用频率相符程度。

如果分析得到的CAI很低，则基因在宿主细胞内的表达水平低，需要对目标序列进行密码子优化。

使用方法

• 输入DNA序列
• 选择遗传密码子表
• 选择表达系统或输入参考序列（二者选一即可）
• 点击 “立即计算密码子适应指数CAI” 按钮
• 10~20s后可得到分析结果